Der Betrieb des Gesundhheitszentrums Rotis wird durch einen gemeinnützigen Verein getragen. Ein Teil des Teams wohnt am Ort des GZR in Rotis, um eine nahe Betreuung der Klienten zu gewährleisten.
Der Betrieb finanziert sich im Wesentlichen aus den Honoraren der Klienten und Besucher sowie durch Spenden. Er ist nicht gewinnorientiert. Spenden werden auch dazu verwendet, Klienten in finanziellen Nöten das Angebot für ein geringeres Honorar zur Verfügung zu stellen.
Der Verein ist beim Amtsgericht Ulm unter der Registernummer VR 723041 eingetragen. Das Finanzamt Wangen im Allgäu hat unter der Steuernummer 91065/41941 dem Verein die Gemeinnützigkeit zuerkannt.